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文档简介
1、,第一结构对高级结构的影响,Protein,生公一班:刘墨兰,王贞治李贤达,李正洋陈燕,尚成宇,制片人:陈燕,蛋白质的结构水平、蛋白质的结构水平、第一结构、第二结构、第二结构、第三结构、第四结构、蛋白质第一结构、蛋白质第一结构(primary structure)蛋白质分子中各种氨基酸的排列顺序。1969年国际纯化学和应用化学联合会(IUPAC)规定。氨基酸序列:多肽链内氨基酸残基按从n到c端排列的顺序排列,氨基酸序列一级结构的主要化学键是肽键,部分包括二硫化键(-S-S-S-)。由于孔刘键的大小,蛋白质的初级结构稳定性很强。牛胰岛素的初级结构,注:数字表示半胱氨酸的数量。人类胰岛素的一级结构
2、,蛋白质的二次结构,二次结构:多肽链主链,折叠形成的主链结构(一肽段的局部空间结构)。主力:二级结构除了肽键外,还是基于氢键的弱作用力,其螺旋主要保持在氢键。蛋白质二次结构的基本形式(分子模型),-螺旋(-helix)最常见、最丰富的二次结构是肽平面单位,由碳转折点形成的坚固的右手螺旋。-折叠(-pleated sheet),-折叠是蛋白质肽链的主要链,肽平面折叠呈锯齿状。-也称为层切面结构。蛋白质的第三级结构,指向整个肽链中所有氨基酸残基的相对空间位置;整个肽链中的所有原子在三维空间中排列。下图是肌红蛋白的第三级结构。蛋白质三阶结构的形成和稳定主要在二次结合、一氢键:多肽链主链之间、注射链和
3、极性侧链之间、极性侧链之间形成氢键。2二硫3离子键,也称为盐键,是由蛋白质带正电荷的组和带负电荷的组形成的。疏水缔合也称为疏水缔合,是在非极性疏水侧链(如缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸)之间形成吸引力的疏水区域。5.蛋白质第三级结构中疏水缔合的数量最多(主要),位于球形蛋白质内部。疏水,离子结合,氢键,范德瓦尔斯力(图)。蛋白质的四阶段结构,四阶段结构:蛋白质分子中每个子单位的空间排列,子单位的接触部分的安排和相互作用。蛋白质的子单位:蛋白质分子中具有单独三级结构的多肽链。具有四阶段结构的蛋白质分子具有复杂的生物学功能,但单独的子键一般没有生物学功能或不完整的功能。蛋白质四阶段结构基于单体
4、蛋白质不存在四阶段结构的三阶段结构。因此蛋白质第四阶段结构的形成仍由第一阶段结构决定。仅供参考,蛋白质的空间结构(高级结构)只有二次结构、三次结构、四次结构等三种。不是所有的蛋白质都有四层结构。只有多亚基蛋白有4级结构。所有蛋白质都有一级结构,二级结构,三级结构。蛋白质的高级结构基本上取决于蛋白质的初级结构。另外,蛋白质在二次结构的基础上形成超二次结构。超二次结构,超二次结构:相邻的二次结构元件结合在一起,徐璐相互作用,作为空间可识别的二次结构组合或二次结构串等三次结构的元件,这称为超二次结构。主力:疏水性对保持超二次结构的稳定性有很大贡献。蛋白质结构和功能的关系,蛋白质的结构是蛋白质功能的基
5、础,什么结构对应什么功能,就是蛋白质结构的多样性导致了其功能的多样性。所以蛋白质的结构决定了它的功能,蛋白质的功能是它的结构的表达。初级结构和空间结构对维持蛋白质的生物活性都有重要作用。,蛋白质主要结构和功能的关系,主要结构是结构的基础,结构决定蛋白质的功能。在初级结构中,保持蛋白质功能区的特定结构需要特定的氨基酸残基。如果这些必需氨基酸残基发生变化,蛋白质特定结构就会被破坏,蛋白质的生物活性也会丧失。因此,初级结构是空间结构的基础。蛋白质空间结构被破坏后,只要第一结构没有被破坏,就可以恢复原来的结构和功能。催化RNA水解的酶核糖核酸酶是由124个氨基酸残基组成的单链。由8个半胱氨酸组成的4个
6、二硫化物组合:测量蛋白质初级结构的应用,推测蛋白质的高级结构。蛋白质的初级结构可以用多种方法测定。出现在多种二次结构中的频率有20种氨基酸不同,因此可以求出各氨基酸的结构因子,预测蛋白质的二次结构。我们在肽键的统计分析中揭示了二肽和三肽的关联频率和二次结构之间的相关性,利用二肽和三肽结构参数可以预测,准确度达到90%。但是蛋白质折叠相当复杂。肽链在体内折叠,比在体内折叠慢。到目前为止,我们无法根据一种蛋白质的初级结构推断出它的三维结构。测定蛋白质初级结构的应用,推测蛋白质功能。蛋白质分子核心活性部位氨基酸残基的变化会影响其生理功能,也会引起分子病。例如镰状细胞贫血,在血红蛋白分子中正常的第二亚
7、基第六位谷氨酸转化为巴林,在酸性氨基酸中由中性分支氨基酸取代,从而降低血红蛋白在红细胞中的溶解能力,从而在氧粉碎下降的外周毛细血管中容易凝聚沉淀,降低红细胞破裂溶血和氧输送功能。蛋白质初级结构的应用测定,生物进化研究。徐璐其他有机体的同源蛋白质初级结构在氨基酸组成和序列上存在差异。同源蛋白质初级结构的差异可以反映从属关系,但不影响其生物学功能。蛋白质的初级结构如何决定高级结构?脯氨酸经常出现在肽链的折叠上,对一级结构(例如一些碱性氨基酸和电荷氨基酸)的蛋白质二级结构起决定性作用。这样,构成蛋白质初级结构的氨基酸之间就形成了氢键、二硫化物键等二次键,形成了折叠等蛋白质二次结构。第三结构由第二结构决定,多个第二结构形成域,第四结构由多个第三结构组成,因此蛋白质的第一结构决定父结构。思维练习,1。蛋白质分子从简单到复杂的结构水平准确表示的下一组是()氨基酸C,h,o,n等化学元素氨基酸分子徐璐结合形成多肽链,具有一定空间结构的蛋白质分子A B C D回答:D .思维练习,2 .
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