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文档简介
1、第2章 蛋白质的构件氨基酸,主要内容,蛋白质:化学组成和分类、水解 氨基酸:分类、酸碱性质、化学反应、 旋光性和光谱性质 氨基酸混合物的分离和分析,一、蛋白质的化学组成和分类,化学组成:所有蛋白质都含有 C、H、O、N 四种元素,大多数蛋白质还含有少量的 S,有些蛋白质还含有一些其它元素,如 P、Fe、Cu、Mo、I等。,蛋白质的平均含氮量为16% 凯氏定氮法:蛋白质含量=蛋白氮*6.25,仅由氨基酸组成,不含其他化学成分 (如清蛋白、球蛋白、组蛋白等),除氨基酸外,还含有其他化学成分 (如糖蛋白、脂蛋白、金属蛋白等),辅基(Prosthetic group),也称作配体(Ligand): 蛋
2、白质中的非蛋白部分,与蛋白质共价或非共价结合,对蛋白质的功能起重要作用;通常为糖、脂、核酸、磷酸、色素和金属离子等。,蛋白质的分类,根据分子形状和溶解度分类:,细棒或纤维状,大都是结构蛋白,如胶原蛋白,弹性蛋白等,不溶于水;有些是可溶性的,如肌球蛋白和血纤蛋白原,外形近似球体,多溶于水,大都具有活性,如酶、转运蛋白、蛋白激素、抗体等,为与膜内的非极性相相互作用,疏水氨基酸侧链伸向外部。不溶于水,能溶于去污剂溶液,仅由一条多肽链构成,如溶菌酶和肌红蛋白,由两条或多条多肽链构成,如血红蛋白和己糖激酶,其中每条多肽链称亚基,二、蛋白质的水解, 酸水解:,6mol/L HCL, 4mol/L H2SO
3、4, 煮沸20h左右 可使蛋白质完全水解,优点:不引起消旋作用 缺点:色氨酸完全被破坏, 羟基氨基酸一小部分被分解, 天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解下来,碱水解:5mol/L NaOH共煮10-20h 可使蛋白质完全水解 优点:色氨酸不被破坏 缺点:多数氨基酸被破坏,并产生消旋现象 精氨酸脱氨 酶水解: 优点:不产生消旋作用,不破坏氨基酸 缺点:一种酶往往水解不彻底,从蛋白质水解产物中分离出来的氨基酸只有20种。 -氨基酸(除脯氨酸):-碳原子上有一个氨基,三、-氨基酸的一般结构,R在稳定蛋白质构象和决定蛋白质功能中起重要作用。,四、氨基酸的分类,根据氨基酸侧链结构,分为三类: 脂肪族氨基酸
4、 杂环族氨基酸 芳香族氨基酸,脂肪族: (15种) 中性氨基酸:甘(Gly)、丙(Ala)、 缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile) 含羟基或硫的氨基酸:丝(Ser)、苏(Thr)、半胱(Cys)、甲硫(Met) 酸性氨基酸及其酰胺:天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln) 碱性氨基酸:赖 (Lys)、精 (Arg) 杂环族:组(His)、脯(Pro) 芳香族:苯丙(Phe)、酪 (Tyr)、色(Trp),1 脂肪族氨基酸(15种),(1)侧链是烃链-中性,后三种人体不能合成,是必需氨基酸,Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,(2)侧链含有羟基,许多蛋白
5、酶的活性中心含有Ser,它还在蛋白质与糖类及磷酸的结合中起重要作用。,(3)侧链含硫原子,胱氨酸,半胱氨酸,两个Cys可通过二硫键结合成一个胱氨酸。二硫键对维持蛋白质的高级结构有重要意义。 半胱氨酸也经常出现在蛋白质的活性中心里。,Met的硫原子有时参与形成配位键。 Met可作为通用甲基供体,参与甲基化反应。,(4)酸性氨基酸及其酰胺,不带电荷,但极性很强,经常出现在蛋白质表面,在蛋白质中带负电荷,经常出现在蛋白质表面,(5)碱性氨基酸,胍基,碱性最强的氨基酸,2.2 杂环氨基酸(2种),咪唑环,亚氨基酸,His是碱性氨基酸,碱性较弱,是否带电与环境有关。,2.3 芳香族氨基酸(3种),吲哚基
6、,都有紫外吸收,可通过测量蛋白质的紫外吸收来测定蛋白质含量,氨基酸可按侧链极性分类: 非极性氨基酸:Ala, Val, Leu, Ile, Pro , Phe, Trp , Met 共八种 极性不带电荷:Gly, Ser, Thr, Cys , Tyr, Asn, Gln共七种 带正电荷: Lys, Arg, His 带负电荷:Asp, Glu,从营养学角度分类: 必需氨基酸(Essential amino acids) (10种): 人不能合成或合成很少。 Lys,Phe,Met,Leu,Ile,Val,Thr,Trp,His,Arg 非必需氨基酸(Nonessential amino ac
7、ids) (10种): 人自己可以合成,不需要有食物供给。,Brnsted-Lowry酸碱质子理论,即广义酸碱理论:,酸是质子供体,碱是质子受体。,五、氨基酸的酸碱性质,氨基酸既能放出质子,也能接受质子,具有酸碱性质,是一类两性电解质。,氨基酸可作为酸(质子供体):,氨基酸可作为碱(质子受体):,不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在:,pH=pI时,主要以兼性离子形式存在。 pHpI时,主要以负离子形式存在, 在电场中向正极移动。,等电点(pI,isoelectric point): 氨基酸所带的净电荷为零时的pH 值,P22,等电点的计算,中性氨基酸:以Gly为例,侧链不解离的中性氨基酸p
8、I: pI=(pK1+pK2)/2,pI = (pK1+pK2)/2,单氨基单羧基: 两阶段曲线,甘氨酸,两氨基或两羧基: 三阶段曲线,带负电荷:天冬氨酸; 谷氨酸 带正电荷:赖氨酸; 精氨酸; 组氨酸,酸性氨基酸,以Asp为例:,pI=(pK1+pKR)/2,谷氨酸,碱性氨基酸,以Lys为例:,pI=(pKR+pK2)/2,组氨酸,1. -氨基参加的反应,六、氨基酸的化学反应,(1)与HNO2的反应,(2)酰基化反应,苄氧酰氯(Cbz-Cl):,对甲苯磺酰氯(Tos-Cl) :,叔丁氧酰氯(Boc-Cl):,氨基酸与丹磺酰氯(DNS-Cl)的反应,强荧光,常用于鉴定蛋白质的N-末端氨基酸残基
9、,(3)烃基化反应,(R烃基), 与2、4一二硝基氟苯的反应,2,4一二硝基氟苯,DNFB,DNP-氨基酸(黄色),被Sanger用来鉴定蛋白质的N-末端氨基酸残基, 与苯异硫氰酸酯(PITC)的反应,PITC,被Edman用于鉴定蛋白质的N-末端氨基酸残基,2. -羧基参加的反应,(1)成盐和成酯反应,(2)成酰氯反应,使aa的羧基活化,常用于肽的人工合成,(3)叠氮反应,使aa的羧基活化,常用于肽的人工合成,肼,3. -氨基和-羧基共同参加的反应,(1)茚三酮反应,(2)成肽反应,肽键:一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基缩水形成的共价键,七、氨基酸的旋光性和光谱性质,1. 旋光性和立体化学 组成蛋白质的氨基酸除Gly外都有手性碳原子,有两种构型称为D-型和L-型。,除Gly外,蛋白质中的氨基酸都是L-型。,以丙氨酸为例:,-氨基位于C左边的为L-型,右边的为D-型.,如含2个手性碳原子,则有种立体异构体,分别称为-,-,别-和别-氨基酸。,L-苏氨酸 (L-threonine),D-苏氨酸 (D-threonine),L-别-苏氨酸 (L-allo-threonine),D-别-苏氨酸 (D-allo-threonine),组成蛋白质的氨基酸除Gly外,都有手性碳原子, 所以都有旋光性。,消旋
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