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1、H松巨盹臼了 1幷干是为I魁怪合话前舟恥啟虐,E垛凰【话的盘格自I SD5-FAGE &TWSIU 下层肢h不同遥盧的d$_pge狩窗胺的昙桂好曲范因=5口占GE分蛋底般度50 150KD嚥底30-QtOkD20-BOO讹腹T2-60k315%薮注!如舷制菲匪性險 彗都肉菽宵彷,刃蔑肢申不加10%SDSPr可配融用冼怪FAftFfo.SDS勒胶的有效分离范阖丙烯联胺浓度L512.5107.55,01乩上业ThZOkDaLfi-lcDa30-J20kDa60-212 kDa1.配胶缓冲液系统对电泳的影响?在SDS- PAG环连续电泳中,制胶缓冲液使用的是 Tris HCL缓冲系统,浓缩胶是,分离
2、胶; 而电泳缓冲液使用的 Tris -甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。 由于导电性与电场强度成反比, 这一区带便形成 了较高的电压剃度, 压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。 当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后, 同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解 决
3、问题的情况,应首要考虑该因素。2样品如何处理?工根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原 SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。1)还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和 DTT (或 Beta巯基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成 SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。一 般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心加样。2)带有烷基化作用的还原 SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的 DTT,而防止银染时的纹
4、理现象。100ul 样品缓冲液中10ul 20 %的碘乙酸胺,并在室温保温30min。3) 非还原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1 %SDS沸水中煮3min,未 加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。SDS电泳凝胶中各主要成分的作用?聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液:浓缩胶选择,分离胶选择,选择tris HCL系统,TEMED与 AP AP提供自由基,TEMED是催化剂,催化自由基引起的聚合反应进行;十二烷基硫酸钠(SDS :阳离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋
5、白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、 去多肽折叠。提高SDS电泳分辨率的途径?聚丙烯酰胺的充分聚合, 可提高凝胶的分辨率。建议做法:待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同染料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编着的蛋白质电泳技术手册P82-103。5“微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因?主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。 处理办法:待其充分凝固再作后续实验。“皱眉(两边向下中
6、间鼓起)形带原因? 主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。 处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。为什么带出现拖尾现象?主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液, 加适量样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长, 重新配制;降低凝胶浓度。为什么带出现纹理现象? _ 主要是样品不溶性颗粒引起的。处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。什么是“鬼带”,如何处理?“鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失
7、去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却于目标条带有相同的免疫学活性,在WB反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。处理办法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta巯基乙醇,以补充不足的还原剂;或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。为什么溴酚蓝不能起到指示作用? 2我们在实验中常会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象。主要与缓冲液和分离胶的浓度有关。处理办法:更换正确 pH值的Buffer ;降低分离胶的浓度。为什么电泳的条带很粗?电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的原因。处理办法:适当
8、增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确();适当降低电压;为什么电泳电压很高而电流却很低呢?这种现象一般初学者易出现。 比如电压50v以上,可电流却在5mA以下。主要是由于电泳槽 没有正确装配,电流未形成通路。包括: a.内外槽装反;b.外槽液过少;c.电泳槽底部的绝 缘体未去掉(比如倒胶用的橡胶皮)。处理办法:电泳槽正确装配即可。浓缩胶与分离胶断裂、板间有气泡对电泳有影响吗?这主要出现在初学者中, 一般对电泳不会有太大的影响。前者主要原因是拔梳子用力不均匀或过猛所致;后者是由于在解除制胶的夹子后,板未压紧而致空气进入引起的。凝胶时间不对,或慢或快,怎么回事?通常胶在30MIN-1H内凝。如果凝的太慢,可能是 TEMED APS剂量不够或者失效。APS应该 现配现用,T
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