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文档简介
.,1,第五讲:BLAST序列比对,.,2,1.BasicLocalAlignmentSearchTool2.Compareaquerysequencetoallthesequencesinaspecifieddatabase,.,3,BLAST的常用种类(详细见教材):1、blastn2、blastp3、tblastn4、blastx5、tblastx,.,4,例1:对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为nt,物种为Eukaryota,.,5,.,6,.,7,.,8,.,9,.,10,.,11,.,12,.,13,.,14,.,15,例2:对给定的olfactoryreceptor基因进行blastn,目标数据库为nt,物种为Eukaryota,.,16,.,17,.,18,.,19,.,20,.,21,.,22,.,23,作业:对给定的2个基因(test1,test2)分别进行blastn,blastp,tblastn,tblastx,blastx,
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