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文档简介
附件广东人感染H7N9禽流感病毒序列分析报告2013年11月8日我所国家流感中心收到广东省疾病预防控制中心送检的1例人感染H7N9禽流感疑似病例标本,11月11日从标本中分离到1株H7N9禽流感病毒,该毒株被命名为A/Guangdong/0092/2013(H7N9)。11月18日完成了全基因组序列测定,并进行了全基因组序列分析,现将结果报告如下。一、HA和NA基因核苷酸、氨基酸序列相似性分析HA核苷酸序列与A/Guangdong/090/2013(H7N9)相似度最高,为99.9%,HA氨基酸序列与A/Guangdong/090/2013(H7N9)相似度最高,为99.8%。NA核苷酸序列与A/Guangdong/090/2013(H7N9)相似度最高,为99.7%,NA氨基酸序列与A/Guangdong/090/2013(H7N9)相似度最高,为99.8%。二、系统发生树分析对A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒的8个片段进行系统发生树分析(见附图1-8),结果表明该病毒的HA、NA与我国之前分离到的人感染禽H7N9病毒在同一分支,其内部片段来源于我国鸡H9N2病毒。三、耐药性分析A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒M2蛋白25-42位氨基酸发生S31N突变,提示对烷胺类药物耐药。A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒NA蛋白276位氨基酸为H、294位氨基酸为R、120位氨基酸为E未发生突变,提示对达菲类药物敏感。四、HA连接肽分析A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒的HA蛋白连接肽为PKGRGLFG,只有一个碱性氨基酸(R),提示为为禽低致病性毒株。五、受体结合位点及其它重要位点分析A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒HA蛋白受体结合位点226位为亮氨酸(L),186位为缬氨酸(V),提示对a2-6受体结合能力增加。150Loop的160位为丙氨酸(A),与H5N1病毒比较缺少N-型糖基化,提示对受体结合能力增加。A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒PB2蛋白627位为谷氨酸(E),提示对小鼠的致病性未增强。A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒PB1蛋白368位氨基酸为缬氨酸(V),提示病毒在雪貂中传播能力增强。473位氨基酸为缬氨酸(V),提示在哺乳动物细胞中复制能力增强。A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒PA蛋白409位氨基酸为天冬酰胺(N),提示可能会增加禽流感病毒在哺乳动物的适应性。(详见附表1)六、小结A/Guangdong/0092/2013(H7N9)病毒与我国2013之前的人感染H7N9禽流感病毒基因组序列类似,病毒的6个内部片段均来源于H9N2禽流感病毒。关键位点分析也与之前分离的病毒类似,表明病毒并没有发生大的变异。也未发现该病毒与人季节性流感病毒、猪流感病毒发生重配。因此病毒基因序列分析结果表明该病毒同既往报道的病毒相似,但应该继续加强对病毒的监测,及时发现可能会导致人际传播的病毒变异。该病毒对烷胺类药物耐药,但是对达菲类药物敏感。同时应该加强对病毒耐药性监测,及时为临床用药提供依据。
HA进化树人感染病例▲HA进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株附图1HA系统发生树NA进化树人感染病例NA进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株附图2NA系统发生树
PB2进化树PB2进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株
PB1进化树PB1进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株
PA进化树PA进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株
NP进化树NP进化树人感染病例▲Guangdong/0092●疫苗代表株
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